Płeć myszoskoczka można określić z większą pewnością po 5 tygodniu życia. Jest to jeszcze zanim myszoskoczki osiągają dojrzałość płciową, więc łatwo jest zapobiec niechcianej ciąży. Doświadczony hodowca jest w stanie określić płeć myszoskoczka już po 3 tygodniach, lub nawet wcześniej. Istnieją cztery główne cechy odróżniające samce od samic.

• Dorosłe samce są z reguły większe od samic, jednak gdy myszoskoczki są młode nie jest to cecha miarodajna, gdyż zależy od wielu czynników - myszoskoczki mogą rosnąć w różnym tempie, gdy dorastają osiągają zwykle typowe rozmiary.
• Dorosłe samce mają na stronie brzusznej przy podstawie ogona wyraźne wybrzuszenie, a ich ciało jest bardziej spiczasto zakończone. Są to oczywiście jądra, których samice nie posiadają. Wybrzuszenie to jest widoczne w 6 tygodniu życia, jednak czasami może się pojawić 2 tygodnie wcześniej.
• Samce od samic odróżnia również brak u tych pierwszych sutków, co można zaobserwować już kilka dni po narodzinach, jednak nie daję to całkowitej pewności.
• Najważniejszą cechą odróżniającą płci myszoskoczków jest odległość między ujściem cewki moczowej, a odbytem. U samic jest ona mniejsza niż u samców i można to określić po 3 tygodniu życia myszoskoczka.

Na zdjęciu po prawej wyraźnie widoczne są różnice w ukształtowaniu okolic genitalnych. Ujście cewki moczowej u samca znajduje się wyraźnie dalej od otworu odbytowego niż u samicy. Widoczne są również jądra. Przy jasnym futerku skóra moszny ma zwykle czarne zabarwienie. Myszoskoczki o czarnej maści zwykle mają mocno owłosioną mosznę, co utrudnia rozpoznanie płci. Na drugim zdjęciu oznaczone są miejsca, w których umiejscowione są sutki u samic. Są one dostrzegalne w niedługim okresie po narodzinach gdy zwierzątko nie jest jeszcze owłosione, z czasem ciemnieją i odnalezienie ich w futerku również nie sprawia problemów, o ile rzeczywiście mamy do czynienia z samicą.

Jak rozpoznać płeć?

1. Umieść myszoskoczka na swojej lewej dłoni, lub na innej stabilnej powierzchni (jeśli jesteś leworęczny, możesz zamienić ręce).
2. Delikatnie, przy użyciu palca wskazującego i kciuka prawej ręki, złap myszoskoczka za podstawę ogona.
3. Unieś myszoskoczka tak, aby opierał się na przednich łapkach.
4. Obejrzyj okolice przy nasadzie ogona. Poniżej znajdują się pomocne fotografie.